Friedrich Fülleborn wurde am 13. September 1866 in Culm geboren. Nach dem Studium der Medizin und Naturwissenschaften trat er in den Militärdienst und erreichte die Position eines Kaiserlichen Regierungsarztes. Er nahm an verschiedenen Expeditionen nach Afrika und in die Südsee teil. Ab 1901 war Fülleborn Leiter der Abteilung für Tropenmedizin und Tropenhygiene am Hamburger Institut für Schiffs- und Tropenkrankheiten, ab 1930 bis zu seinem Tod am 9. September 1933 in Hamburg leitete er dieses Institut und war Inhaber des Lehrstuhls für Tropenmedizin an der Hamburgischen Universität.
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